Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms