Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBB6Q9BUF5 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBB6Q9BUF5 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms