Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNS3Q9BQ31 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms