Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PCNX1Q96RV3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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