Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms