Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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LRRC28Q86X40 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC28Q86X40 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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