Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP9Q5VTM2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AGAP9Q5VTM2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms