Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC39A12Q504Y0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC39A12Q504Y0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.6 ms