Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms