Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL40Q2TBA0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms