Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms