Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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