Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC6Q16204 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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