Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SPIDRQ14159 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms