Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PKP1Q13835 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PKP1Q13835 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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