Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RUNX3Q13761 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RUNX3Q13761 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RUNX3Q13761 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX3Q13761 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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