Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMC2Q13753 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMC2Q13753 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms