Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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