Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
IKZF1Q13422 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms