Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CPT1C-203ENST00000392518 2910 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms