Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SGCGQ13326 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCGQ13326 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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