Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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IFT88Q13099 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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