Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC173Q0VFZ6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms