Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC15Q0P6D6 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms