Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNEQ04844 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms