Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms