Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMF1P82094 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMF1P82094 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMF1P82094 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms