Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IRX1P78414 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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