Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BACE1P56817 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BACE1P56817 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BACE1P56817 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms