Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OXCT1P55809 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms