Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAD23BP54727 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD23BP54727 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms