Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PGGT1BP53609 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PGGT1BP53609 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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