Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RECQLP46063 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RECQLP46063 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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