Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK1P39086 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms