Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H1P32780 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms