Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC8P31273 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC8P31273 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.7 ms