Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR2P28476 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms