Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLD1P28340 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms