Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC9A1P19634 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms