Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIG1P18858 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LIG1P18858 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms