Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GJA1P17302 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms