Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BMP3P12645 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BMP3P12645 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BMP3P12645 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BMP3P12645 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BMP3P12645 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms