Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SFTPCP11686 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SFTPCP11686 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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