Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRF1P10914 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRF1P10914 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms