Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PGA3P0DJD8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms