Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EDN1P05305 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDN1P05305 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDN1P05305 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDN1P05305 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms