Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSF2P04141 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSF2P04141 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSF2P04141 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms