Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SPTA1P02549 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTA1P02549 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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