Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR5O60602 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR5O60602 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLR5O60602 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms