Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms